Родился в г. Курске в семье врачей.
Окончил городскую, общеобразовательную, среднюю, школу №5.
В 1948 г. поступил в Курский государственный медицинский институт (КГМИ, окончил в 1954).
В 1959-1961 гг. работал в институте ассистентом, доцент (1961-1964).
В 1959 г. защитил кандидатскую диссертацию на тему «Гипносуггестивная и условнорефлекторная терапия некоторых дерматозов».
В 1964 г. — диссертацию «Нейродерматозы (этиология, патогенез, лечение)» на соискание учёной степени доктора медицинских наук.
В 1964-1968 — профессор и заведующий кафедрой кожно-венерических болезней КГМИ .
В 1970-1973 гг. — декан педиатрического факультета.
В 1973-1980 гг. — заведующий кафедрой кожно-венерических болезней 2-го Московского государственного медицинского института.
С февраля 1980 г. по 1999 г. возглавлял Центральный научно-исследовательский кожно-венерологический институт (ЦНИКВИ) Минздрава РФ.
В 1984 г. избран членом-корреспондентом АМН СССР.
В 1988 г. — действительный член АМН СССР (ныне РАМН).
С 1999 г. по настоящее время (2004) является Почётным научным руководителем института.
Фундаментальные исследования Ю.К. Скрипкина:
Изучение роли иммунных расстройств и нейроэндокринных сдвигов в патогенезе дерматозов;
Заболевания соединительной ткани и сосудов кожи;
Совершенствование методов лечения наиболее распространённых и тяжело протекающих хронических дерматозов;
Разработка наиболее эффективных средств терапии сифилиса и негонорейных заболеваний мочеполовых органов (хламидиоза, уреаплазмоза, микоплазмоза, некоторых вирусов),
Изыскание и Совершенствование социально-эпидемиологических путей борьбы со СПИДом,
Вопросы профилактики СПИДАа, заболевание и другие болезни, передающиеся половым путём.
Ю.К. Скрипкин внёс значительный вклад в развитие отечественной дерматовенерологии, создал научную школу высококвалифицированных кадров.
Под его руководством и при консультировании выполнены и защищены 39 докторских и 72 кандидатские диссертации.
Ю.К. Скрипкин — автор, более 500 научных работ, в т. ч. 18 монографий, 4 учебников, среди которых первый в Советском Союзе учебник по детской дерматологии, 15 изобретений.
Ю.К. Скрипкин — Почётный президент Российского научного общества дерматологов и венерологов, Заместитель редактора раздела дерматовенерологии Большой медицинской энциклопедии, член редколлегии журнала «Вестник дерматологии и венерологии», Председатель Межведомственного совета по дерматологии и венерологии РАМН, член Терапевтического экспертного совета ВАК РФ, заместитель председателя диссертационного совета ГУ ЦНИКВИ, председатель учебно-методической комиссии по дерматологии Минздрава РФ. Член Европейской ассоциации дерматологов и венерологов и Американской ассоциации дерматологов и венерологов, президент Евразийской трихологической ассоциации, Заслуженный деятель науки Российской Федерации (1999).
Награды: орден Дружбы народов (1993), орден «Знак Почёта» (1986), медаль «За доблестный труд» (1970), медаль «За освоение целинных земель» (1958), другие знаки отличия.
Bcт.: БКЭ. - Курск, 2005. - Т. 1, кн. 3. - С. 46 – 47.